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填充柱是指填充了固定相的色譜柱。將色譜分析的固定相（吸附劑、涂漬了固定液的載體、離子交換樹脂、凝膠顆粒等）作為填料，填充于一定口徑、長度和形狀的柱管中。填充柱的優點是制備和使用方法都比較容易掌握，具有多種填料可供選擇，能滿足一般樣品分析要求。
一、氣相填充柱的平衡
氣相填充柱由工廠測試后是保存在乙腈/水中的。新柱應先使用10-20倍柱體積的甲醇或乙腈沖洗氣相填充柱。一定確保分析樣品所使用的流動相和乙腈/水互溶。
每天用足夠的時間以流動相來平衡氣相填充柱，就會在處理問題方面獲得最大的"補償"，而且氣相填充柱的壽命也會變得更長。
二、氣相填充柱的保養
氣相填充柱在使用前，最好進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。
但要注意：柱性能可能由于所使用的樣品、流動相、柱溫等條件的差異而有所不同；另外，在做柱性能測試時是按照色譜柱出廠報告中的條件進行(出廠測試所使用的條件是最佳條件)，只有這樣，測得的結果才有可比性。在對氣相填充柱使用前進行測試以后，要根據不同的情況對色譜柱進行保養：
①每天實驗后的保養：使用緩沖液或含鹽的流動相，實驗完成后應用10%的甲醇/水沖洗30分鐘，洗掉色譜柱中的鹽，再用甲醇沖洗30分鐘。注意：不能用純水沖洗柱子，應該在水中加入10%的甲醇，防止將填料沖塌陷。
②長期保存氣相填充柱：如氣相填充柱要長時間保存，必須存于合適的溶劑下。對于反相柱可以儲存于純甲醇或乙腈中，正相柱可以儲存于嚴格脫水后的純正己烷中，可以儲存于水（含防腐劑疊氮化鈉或柳硫汞）中，并將購買新氣相填充柱時附送的堵頭堵上。儲存的溫度最好是室溫。
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